Mga paghahanda ng enzimay nagmula sa mga organismo at sa pangkalahatan ay mas ligtas at maaaring magamit sa naaangkop na halaga ayon sa mga pangangailangan sa produksyon. Mayroong tatlong pangunahing mga grupo ng mga mikroorganismo na gumagawapaghahanda ng enzyme: filamentous fungi, yeasts, at bacteria, pangunahin na gumagamit ng mahusay na air bacteria. Ang mga strain at paggamit ng maraming pangunahing mga pang-industriya na enzyme ay ang mga sumusunod:
(1) Amylases
Ang amylase hydrolyzes starch upang makabuo ng pasty malto-oligosaccharides at maltose. Pangunahin itong ginawa ng submerged fermentation ng Bacillus subtilis at Bacillus licheniformis ng genus Bacillus, at ang huli ay gumagawa ng termostable na mga enzyme. Bilang karagdagan, ginawa rin ito ng nakalubog at semi-solid pagbuburo na may mga strain ng Aspergillus at Rhizopus, na angkop para sa pagproseso ng pagkain. Pangunahing ginagamit ang Amylase para sa paggawa ng asukal, desizing ng tela, pagbuburo ng raw na materyal na pagpoproseso at pagproseso ng pagkain. Maaaring i-hydrolyze ng Glucoamylase ang almirol sa almukol, na ngayon ay halos lahat ay ginawa ng Aspergillus niger nakalubog na pagbuburo para sa produksyon ng asukal, paggawa ng alkohol, pagbuburo ng raw na materyal na pagpoproseso, atbp.
(2) Protease
Ang pinaka ginagamit na mga kalat at mga pagkakaiba-iba ng produksyon. Gumamit ng Bacillus licheniformis, Bacillus pumilus at Bacillus subtilis upang makagawa ng mga protease ng bakterya sa pamamagitan ng paglubog ng pagbuburo; gumamit ng Streptomyces at Aspergillus lubog na pagbuburo upang makabuo ng walang kinikilingan na protease at Aspergillus acid protease para sa depilation ng katad, paglambot ng balahibo, parmasya at industriya ng pagkain; Ang ilang mga bakterya ng genus na Mucor ay sumasailalim sa semi-solid fermentation upang makabuo ng rennet, na pumapalit sa rennet na orihinal na nakuha mula sa guya tiyan sa paggawa ng keso.
(3) Glucose isomerase
Isang pagkakaiba-iba na mabilis na umunlad noong dekada 1970. Una, nakalubog na pagbuburo ay ginagamit upang makakuha ng mga cell ng Streptomyces. Pagkatapos ng immobilization, ang solusyon sa glucose ay ginawang isang syrup na naglalaman ng halos 50% fructose. Ang syrup na ito ay maaaring magamit sa industriya ng pagkain sa halip na sucrose. Ang paggamit ng amylase, glucoamylase at glucose isomerase upang makabuo ng fructose syrup mula sa mais starch ay naging isa sa mga umuusbong na industriya ng asukal.
